Приказом Федеральной миграционной службы, Министра обороны Российской Федерации от 15 апреля 2011 г. N 100/507 г. Москва "Об утверждении Инструкции о порядке взаимодействия ФМС России, территориальных органов ФМС России и их структурных подразделений с Минобороны России, военными комиссариатами и отделами военных комиссариатов при оформлении гражданам Российской Федерации, подлежащим призыву на военную службу либо направлению на альтернативную гражданскую службу, паспорта гражданина Российской Федерации, удостоверяющего личность гражданина Российской Федерации за пределами территории Российской Федерации" при оформлении загранпаспортов лица призывного возраста устанавливается обязательная процедура по направлению запросов в военкомат.

С текстом приказа и инструкции можно ознакомиться в разделе "Военное законодательство"